文献类型： 中文期刊
作者： 余乃通 1 ; 孙玉娟 2 ; 张雨良 1 ; 罗志文 3 ; 刘志昕 4 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
2.海南大学环境与植物保护学院
3.海南省农业科学院热带果树研究所农业部海口热带果树科学观测实验站
4.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室
关键词： 香蕉;巴西橡胶;cat基因;克隆;序列分析
期刊名称： 植物研究
ISSN： 1673-5102
年卷期： 2012 年 32 卷 01 期
页码： 47-53
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 根据GenBank上已有的植物cat基因序列,设计一对兼并引物。在海南岛采集香蕉、巴西橡胶、黄灯笼辣椒、菠萝、甘蔗、番木瓜等作物的叶片并提取总RNA,反转录成cDNA,PCR进行同源克隆。结果获得了巴西橡胶cat-1和香蕉的cat-2基因,而未获得其它4种作物cat相关基因。序列分析发现,巴西橡胶cat-1和香蕉的cat-2基因开放阅读框(ORF)都为1 479 bp,编码492个氨基酸,GenBank登陆号分别为HQ660587和HQ660588。生物信息学软件分析巴西橡胶CAT-1和香蕉CAT-2蛋白的三级结构分别与Exiguobacteriu Oxidotolerans(PDB code:2j2mA0)和Pseudomonas Syringae(PDB code:1m7sA)相似。构建系统发育树表明巴西橡胶CAT-1与蓖麻CAT-1氨基酸序列(Ricinus communis:XP_002521709.1)同源性最高,为92.1%;香蕉CAT-2与油棕CAT-2氨基酸序列(Elaeisguineensis:ACF06566.1)同源性最高,达90.9%。
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