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大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 杜芳芳 1 ; 白俊杰 1 ; 李胜杰 1 ; 李小慧 1 ; 樊佳佳 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词： 大口黑鲈;垂体特异性转录因子;单核苷酸多态性(SNPs);关联分析

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2011 年 35 卷 06 期

页码： 4-11

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用基因组步移技术克隆了大口黑鲈垂体特异性转录因子POU1F1启动子序列,该序列全长1 629 bp,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点。采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POU1F1启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型。对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长、体高和体宽等方面明显高于BB型个体,但基因型为AB型和AA型的个体之间在体质量方面没有明显差异。该研究结果为下一步进行分子标记辅助选择提供了基础。

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