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猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 禹乐乐 1 ; 滕蔓 2 ; 罗俊 2 ; 迟佳琦 2 ; 余祖华 2 ; 柴书军 2 ; 梁晓晓 2 ; 张改平 2 ; 王爱萍 1 ;

作者机构: 1.郑州大学生物工程系

2.河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室

关键词: 猪;乙脑病毒;全基因组;系统进化分析

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2012 年 27 卷 05 期

页码: 184-190

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解猪源乙型脑炎病毒(JEV)的全基因组结构及其分子进化规律,测定了3个JEV猪源分离株(BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3和CSF.XZ-2D)的全基因组序列,并对它们的氨基酸序列进行了分析。结果表明,CSF.XZ-2D全长为10 976 nt,而BSF.ZZ-1和BSF.ZZ-3全长均为10 977 nt,在后2个毒株基因组的10 701 nt位点处均有1个插入碱基"G"。BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3、CSF.XZ-2D与SA14株核苷酸和氨基酸同源性较高,核苷酸同源性都为99.4%,氨基酸同源性均为99.0%,与猪源分离株HW(HW1)、HWe(HW2)和SH0601的核苷酸与氨基酸同源性均为98.0%以上。用涵盖全部5个基因型的30个JEV毒株的全基因组序列构建系统进化树,发现这3个猪源分离株位于同一进化分支,均属于基因Ⅲ型。

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