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基于辣椒基因组重测序的InDel标记开发及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 郭广君 1 ; 孙茜 1 ; 刘金兵 1 ; 潘宝贵 1 ; 刁卫平 1 ; 戈伟 1 ; 高长洲 1 ; 王述彬 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

关键词: 辣椒;重测序;InDel标记;种质鉴定

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2015 年 31 卷 06 期

页码: 1400-1406

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基于全基因组重测序进行分子标记开发是一种新的方法和趋势。本研究基于辣椒全基因组重测序数据鉴定出的InDel位点,在2号染色体上随机选择并设计了40个InDel标记,以24份辣椒种质验证其有效性。结果显示:40个标记可获得扩增产物,其中具有多态性的标记35个,多态率为87.5%,同时35个标记可以有效地区分24份辣椒种质的多样性和特异性。以上结果表明,基于重测序数据开发辣椒InDel标记切实可行。

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