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RAPD多态位点数变化对小豆遗传变异信息估计的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 文自翔 1 ; 金文林 1 ; 濮绍京 1 ; 赵波 1 ; 卢为国 2 ; 李海朝 2 ; 李金英 2 ;

作者机构: 1.北京农学院

2.河南省农业科学院

关键词: 小豆;遗传相似系数;RAPD;多态位点数

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2010 年 25 卷 01 期

页码: 79-83

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以163份来自于中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔和越南6国的各种类型小豆种质资源的大样本群体为材料,利用27条RAPD引物检测该群体得到的261个等位基因数据构建成"总群体",采用完全随机抽样方法,研究不同样本容量(样本位点数)与系统遗传相似系数(Jaccard系数)变化的关系,并进一步配置出不同引物数量、多态位点与Jaccard系数的变异系数曲线方程,通过分析回归曲线的相应切点,确定在一定精度下适合的引物数量及多态位点数。研究结果表明:不同引物数量之间的Jaccard系数的标准差、平均数、变异系数差异极显著。不同引物数量、不同多态位点与Jaccard系数的变异系数、标准差回归方程为Y=a+b/X形式,决定系数均在0.95以上。RAPD遗传信息分析精度控制在5%~10%时的最适样本容量为15~32条随机引物或120~230个多态性位点。

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