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暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高莹莹 1 ; 刘新富 2 ; 胡鹏 3 ; 刘滨 4 ; 郭正龙 5 ;

作者机构: 1.上海海洋大学水产与生命学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室

3.青岛市鱼类种子工程与生物技术重点实验室

4.内江师范学院

5.江苏中洋集团股份有限公司

关键词: 暗纹东方鲀;sox9基因;cDNA克隆;生物信息学;组织表达

期刊名称: 上海海洋大学学报

ISSN: 1674-5566

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 835-847

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为初步探究暗纹东方鲀sox9基因在性腺发育和性别分化过程中的作用,通过设计兼并引物、RACE及荧光定量PCR技术,成功克隆出暗纹东方鲀sox9基因的cDNA全长序列,并分析其相应的生物信息学特征及其在雌雄个体的组织表达水平。结果表明:sox9a基因cDNA全长为1 248 bp(NCBI登录号:MH218818),包括684 bp的ORF,编码227个氨基酸,297 bp的5′UTR和267 bp的3′UTR。sox9b基因全长为1 941 bp(NCBI登录号:MH218819),包括1 470 bp的ORF,编码489个氨基酸,306 bp的5′UTR和165 bp的3′UTR。同源性和系统发育分析结果表明暗纹东方鲀sox9基因与红鳍东方鲀同源性最高,亲缘关系最近。氨基酸多重序列比对结果显示两个Sox9氨基酸序列的HMG box结构域在哺乳动物和鱼类中均高度保守。荧光定量PCR分析显示两个sox9基因普遍存在于雌鱼和雄鱼的各个组织中,且均在雌鱼下丘脑中表达量最高,在精巢中有少量表达,卵巢中几乎不表达。总体来说,除少数组织外,两个sox9基因在雌鱼组织中的表达量普遍高于雄鱼。本研究为了解暗纹东方鲀sox9的遗传特性及相关的生理功能,探索性别分化与性腺发育的分子调控机制提供理论依据。

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