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基于高通量测序的池塘养殖半滑舌鳎消化道菌群的结构特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张正 1 ; 李彬 1 ; 王印庚 1 ; 廖梅杰 1 ; 王岚 1 ; 荣小军 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 半滑舌鳎;池塘养殖;菌群结构;高通量测序

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2015 年 39 卷 01 期

页码： 38-45

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用高通量测序方法研究了池塘养殖半滑舌鳎消化道和池水、池塘底泥、颗粒饵料中的微生物菌群结构,并分析了它们之间的相关性。实验结果证实,养殖池塘池水、底泥和饵料中的细菌种类多样性要远高于半滑舌鳎消化道中的细菌多样性,但消化道中的菌群结构与池水和池塘底泥中的细菌没有相关性,仅在一定程度上受到颗粒饵料中菌群的影响。而半滑舌鳎消化道不同部位的细菌种类多样性存在一定的差异,但优势菌群的组成并没有明显的结构差异,优势菌种的构成和相对数量比例非常相似,并且大部分的优势菌种在NCBI数据库中没有同源菌株。研究说明半滑舌鳎消化道菌群这一微生态系统的结构相对独立,在池塘养殖这一阶段几乎不受养殖环境中菌群的影响,而且定植肠道中的一些优势细菌种类可能具有宿主特异性。

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