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基于高密度遗传图谱定位水稻籽粒性状QTL

文献类型: 中文期刊

作者: 孙志广 1 ; 徐婷婷 2 ; 刘艳 1 ; 邢运高 1 ; 徐波 1 ; 迟铭 1 ; 李景芳 1 ; 周群 1 ; 王德荣 1 ; 张雅馥 1 ; 王宝祥 1 ; 徐大勇 1 ;

作者机构: 1.连云港市农业科学院/江苏省现代作物生产协同创新中心

2.江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所

关键词: 籽粒性状;千粒重;QTL;高密度遗传图谱

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2024 年 25 卷 007 期

页码: 1129-1139

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 籽粒性状直接影响水稻的产量和品质,因此,解析水稻籽粒性状的遗传机制对提高水稻产量和品质至关重要。本研究以籽粒性状差异较大的穞稻和广百香占为亲本构建定位群体,利用水稻1 K mGPS SNP芯片对定位群体进行基因分型,构建了包含770个Bin标记的高密度遗传图谱,通过QTL定位分析,最终鉴定出17个调控籽粒性状的QTLs,其中粒长QTL 4个,粒宽QTL 3个,粒厚QTL 3个,长宽比QTL 2个,千粒重QTL 5个,LOD值介于2.55~42.44之间,表型贡献率介于4.73%~29.63%之间。在这17个QTLs中,9个为已知粒型基因位点,8个可能是新鉴定位点,分别为粒长qGL6,粒宽qGW5、qGW10和qGW12,粒厚qGT10,长宽比qGLWR5-2,千粒重qTGW10和qTGW11。根据新发现粒宽QTL(qGW5)定位区间内的基因注释、与拟南芥的同源基因比对、时空表达分析、激素响应分析和序列分析,最终筛选到1个编码CCCH类锌指蛋白的调控水稻粒宽的候选基因Os05g0195101。本研究为进一步开展水稻籽粒性状基因的克隆和遗传调控的解析奠定了基础。

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