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杜仲SQS基因的特征信息分析

文献类型： 中文期刊

作者： 雷跃 1 ; 杨仕梅 1 ; 张天缘 1 ; 赵德刚 1 ; 宋莉 1 ;

作者机构： 1.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室;贵州省农业科学院

关键词： 杜仲鲨烯合酶基因;萜类化合物;生物信息学;基因结构;功能预测

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2019 年 38 卷 06 期

页码： 1-7

摘要： 鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析。从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5～6个外显子;EuSQS蛋白含396～440 aa,相对分子质量为45.73～49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近。分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据。

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