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乌鲁木齐10号冷泉细菌群落密度实时荧光定量PCR检测体系的建立

文献类型： 中文期刊

作者： 唐凤 1 ; 史应武 2 ; 李萍 1 ; 罗娇 3 ; 晁群芳 1 ;

作者机构： 1.新疆大学生命科学与技术学院

2.新疆农业科学院微生物应用研究所

3.石河子大学生命科学学院

关键词： 乌鲁木齐10号冷泉;实时荧光定量PCR;绝对定量

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2015 年 52 卷 10 期

页码： 1872-1877

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】初步建立乌鲁木齐10号冷泉泉水细菌群落的定量分析体系。【方法】选用地震前与地震后的乌鲁木齐10号冷泉水样,以及无震时期的水样做为三种处理方式,利用构建克隆子的方法制作标准样品,并对实时荧光定量PCR标准曲线的线性(R~2)、斜率(S)、扩增效率(E)等相关参数进行优化。【结果】标准曲线的线性R~2=0.993、以及斜率S=-3.415,E=1.963均基本符合参数要求。震前冷泉水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到1.893×10~5 cop/mL,震后冷泉水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到1.43×10~6 cop/mL无震时期水体细菌16 S rDNA片段拷贝数达到9.931×10~6 cop/mL。【结论】建立的实时荧光定量PCR检测体系符合参数要求,并且可以灵敏地、快速地定量未知模板的乌鲁木齐10号泉细菌数。

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