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菠萝MADS-box基因AcMADS2的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨祥燕 1 ; 蔡元保 2 ; 张治礼 3 ; 孙光明 4 ; 孙伟生 4 ;

作者机构： 1.广西亚热带作物研究所

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.海南省农业科学院

4.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 菠萝;MADS-box基因;克隆;基因表达

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2016 年 09 期

页码： 1406-1412

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR和RACE方法从菠萝克隆获得一个MADS-box基因,命名为Ac MADS2,Gen Bank登录号为KC257409。AcMADS2基因c DNA全长945 bp,ORF为687 bp,编码一个含有228个氨基酸的蛋白。序列分析和系统进化分析表明,AcMADS2具有保守的MADS-box结构域和半保守的K区,与其他植物中的AGL12亚家族MADS-box蛋白具有很高的同源性。生物信息学分析结果表明,Ac MADS2是不稳定的亲水蛋白,不具有跨膜结构和信号肽。α-螺旋、折叠延伸链及无规则卷曲构成了二级结构的主要蛋白框架。在三级结构中MADS-box结构域构成了该蛋白核心结构,并且作为转录因子可能定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明,Ac MADS2基因在花期根中的表达量明显高于同一时期的小花、茎和叶;干旱和低温胁迫处理后,Ac MADS2基因在苗期根中的表达也明显增强。因此,推测Ac MADS2基因可能参与菠萝根发育的调控以及逆境胁迫反应。

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