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猪丹毒杆菌SpaA基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林琳 1 ; 江斌 1 ; 吴胜会 1 ; 张世忠 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

关键词： 猪丹毒杆菌;表面保护性抗原A;二级结构;B细胞抗原表位

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2013 年 33 卷 08 期

页码： 1232-1236

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆猪丹毒杆菌表面保护性抗原A(surface protein A,SpaA)的编码基因,并预测该蛋白的二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨猪丹毒杆菌SpaA蛋白在免疫保护中所起的作用。首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR扩增、克隆和测序,并进行同源性比较。应用生物信息学方法,对猪丹毒杆菌SpaA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。结果显示,猪丹毒杆菌SpaA基因全长1 881bp,编码626个氨基酸,发育进化树结果表明分离的2株猪丹毒杆菌菌株与GenBank中其他菌株在进化树中关系较远,自成一个分支。二级结构的预测结果显示该蛋白主要以无规则卷曲、α螺旋和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该蛋白有14个B细胞优势抗原表位区域、8个N-肉豆蔻酰化位点。该研究为进一步分析猪丹毒杆菌免疫机理、表位疫苗设计等奠定理论基础。

  • 相关文献

[1]副猪嗜血杆菌神经氨酸酶的克隆测序与生物信息学分析. 车勇良,陈如敬,王隆柏,江斌,吴学敏,刘玉涛,庄向生,周伦江. 2013

[2]猪丹毒杆菌的分离鉴定及其SpaA基因的遗传变异分析. 车勇良,陈如敬,王隆柏,魏宏,吴学敏,俞玉鸿,庄向生,周伦江. 2011

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