文献类型: 中文期刊
作者: 张靖鹏 1 ; 陈翠腾 1 ; 林琳 1 ; 付环茹 1 ; 李兆龙 1 ; 江斌 1 ; 黄瑜 1 ; 万春和 1 ;
作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省禽病防治重点实验室/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心
关键词: 信鸽;鸽微RNA病毒;3C基因;序列分析;实时荧光定量RT-PCR方法
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2024 年 002 期
页码: 860-866
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus, PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其基因特征后,设计特异性实时荧光定量RT-PCR检测(RT-qPCR)引物组,建立检测PiMeV的RT-qPCR方法。结果显示:PiMeV-CHN001株3C基因全长为591 bp,编码197个氨基酸,和其他2株野鸽源PiMeV(MeV-B1株和MeV-B2株)核苷酸相似性分别为89.5%和92.0%。建立的检测PiMeV的RT-qPCR方法的标准曲线Y轴截距为37.93,斜率为-3.335,相关系数为1.00,扩增效率为99.4%。特异性强,仅PiMeV出现特异性扩增信号和特异性峰值[Tm值为(81.69±0.22)℃],对鸽源禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)、鸽源禽I型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type I,PPMV-1)、鸽输血传播病毒(pigeon torque teno virus, PTTV)、鸽腺病毒(pigeon adenovirus, PiAd)及鸽圆环病毒(pigeon circovirus, PiCV)检测均未见特异性扩增信号;敏感性优,最低检测限为54.0拷贝·μL-1;重复性好,批内和批间变异系数均低于1.5%。用建立的检测方法对42份信鸽粪便样品进行检测,发现2份阳性样品(阳性率为4.76%)。本研究首次证实我国大陆地区信鸽中存在PiMeV,丰富了PiMeV宿主谱信息;建立的RT-qPCR方法为后续开展PiMeV流行病学研究提供支撑。
- 相关文献
[1]猪轮状病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法的建立. 陈如敬,章秋月,陈秋勇,修金生,吴学敏,严山,周伦江. 2018
[2]多花水仙WRKY转录因子的克隆与序列分析. 李欢,何炎森,李科,申艳红,吴用,陈晓静. 2014
[3]三株鸭源H9N2亚型禽流感病毒福建株全基因的测序及遗传进化分析. 万春和,傅光华,施少华,程龙飞,陈红梅,黄瑜. 2012
[4]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010
[5]伪狂犬病毒Fa株gB、gC、gD基因的克隆与序列分析. 陈振海,林天龙,陈少莺,宋铁英. 2007
[6]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009
[7]多花水仙HDS基因cDNA全长克隆与序列分析. 吴用,何炎森,李科,申艳红,李欢,陈晓静. 2015
[8]琯溪蜜柚黄龙病病原的克隆及序列分析. 田亚南,柯穗,李韬,柯冲. 2002
[9]番鸭呼肠孤病毒σB和σNS基因克隆及序列分析. 林锋强,胡奇林,欧阳岁东,陈仕龙,程晓霞,王劭,朱小丽. 2006
[10]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018
[11]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018
[12]猪伪狂犬病病毒MQ18变异株的分离鉴定. 曾显成,池雪林,潘启东,陈珍珍,林琳,修金生,江斌. 2019
[13]福建黄兔Nramp1基因的克隆及序列分析. 陈冬金,桑雷,孙世坤,陈岩锋,王锦祥,谢喜平. 2019
[14]鸭腺病毒A型Hexon基因克隆与序列分析. 万春和,刘荣昌,陈翠腾,程龙飞,傅光华,傅秋玲,施少华,陈红梅,黄瑜. 2017
[15]福建白兔钙蛋白酶抑制蛋白基因的克隆及其表达差异研究. 陈冬金,桑雷,孙世坤,陈敏卿,陈岩锋,王锦祥,谢喜平. 2022
[16]鹅圆环病毒JX1株ORF3基因序列分析. 万春和,黄瑜. 2020
[17]番鸭呼肠孤病毒MW9710株δC蛋白基因的克隆和序列分析. 欧阳岁东,胡奇林,林锋强,陈少莺,陈仕龙,程晓霞,朱小丽. 2006
[18]伪狂犬病病毒FJ-2015株主要免疫原基因的遗传进化分析. 陈秋勇,吴学敏,车勇良,陈如敬,王晨燕,刘玉涛,严山,王隆柏,周伦江. 2018
[19]鸡新城疫病毒F48E9强毒株NP基因的序列分析. 陈珍,施少华,程龙飞,傅光华,陈红梅,万春和,林芳,林建生,黄瑜. 2009
[20]福建青梅rDNA ITS区克隆与序列分析. 翟焕趁,宋亚娜,郑伟文. 2008
作者其他论文 更多>>
-
尾丝蛋白在噬菌体吸附鸭疫里默氏菌中的作用
作者:刘娜;黄瑜;陈红梅;江南松;刘荣昌;傅光华;傅秋玲;梁齐章;万春和;李昂;程龙飞
关键词:鸭疫里默氏菌;噬菌体;尾丝蛋白;吸附
-
高海拔牛粪的堆肥发酵对其营养成分、微生物组成及耐药性基因ARG丰度的影响
作者:李兆龙;闫露;肖学奎;王燕桃
关键词:高海拔;牛粪;堆肥发酵;ARG
-
黑龙江省扶余市麦穗鱼舌状绦虫裂头蚴的分子鉴定和系统发育分析
作者:陈秀琴;邱阳元;郑敏;林甦;江斌;王劭;黄梅清
关键词:舌状绦虫;分子鉴定;系统发育分析;核糖体内转录间隔区;线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ
-
鸭疫里默氏菌噬菌体宿主谱的拓宽
作者:程龙飞;江南松;刘荣昌;傅秋玲;梁齐章;万春和;黄瑜;傅光华;陈红梅
关键词:鸭疫里默氏菌;噬菌体;噬菌谱;拓宽
-
冠突散囊菌Ec-12上清抑制小鼠的伤寒沙门菌机制的初步分析
作者:李兆龙;孔祥瑞;林锋强;王秀萍;赵冉;彭小莉;陈常颂
关键词:冠突散囊菌;上清;鼠伤寒沙门菌;抑制
-
福建省部分规模化畜禽场隐孢子虫感染情况调查
作者:林琳;江斌;陈秀琴;吴胜会;张世忠;蔡羲
关键词:规模化畜禽场;隐孢子虫;感染调查
-
植物乳杆菌胞外多糖对断奶仔猪生长性能、血清生化与免疫指标及肠道组织学的影响
作者:李兆龙;闫露;肖学奎;谢荔朋;施少华
关键词:植物乳杆菌;胞外多糖;断奶仔猪;免疫指标;抗氧化指标;细胞凋亡