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梭梭EF-hand CaBP基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周晓燕 1 ; 甘晓燕 1 ; 石磊 1 ; 陈虞超 1 ; 李苗 1 ; 宋玉霞 1 ;

作者机构: 1.宁夏农业生物技术重点实验室

关键词: 梭梭;钙结合蛋白;EF-hand手型;序列分析

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2012 年 21 卷 06 期

页码: 47-52+57

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出EF-handCaBP(EF-hand calcium-binding protein)基因的cDNA序列(GenBank登录号为JQ023165),其开放阅读框为732bp,推测的氨基酸序列全长为243个氨基酸残基。运用SMART、GOR4、TMPred等生物信息学软件对梭梭EF-hand CaBP功能域、跨膜结构进行分析显示,梭梭EF-hand CaBP含有26个氨基酸的信号肽序列及4个保守的钙结合位点(EF-hand),并且存在2种跨膜模型,推测梭梭EF-hand CaBP基因可能定位于液泡膜或叶绿体膜上。

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