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桃同株叶片杂色材料的MSAP分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蔡志翔 1 ; 沈志军 1 ; 马瑞娟 1 ; 严娟 1 ; 俞明亮 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

关键词： 桃;嵌合体;DNA甲基化;甲基化敏感多态性扩增(MSAP)

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2016 年 32 卷 03 期

页码： 662-667

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探寻桃同株叶片杂色材料PCM-1的突变机制,建立了桃PCM-1G和PCM-1R DNA样品的基因池,用256对甲基化敏感扩增多态性(MSAP)选择性扩增引物进行全基因组甲基化MSAP分析。筛选出23对条带清晰、丰富且重复性好的引物组合。扩增出200~1 000 bp的位点397个,其中PCM-1G、PCM-1R两种类型半甲基化位点分别为38个和44个,分别占全部位点的9.6%和11.1%;全甲基化位点分别为64个和67个,分别占全部位点的16.1%和16.9%;总甲基化率分别为25.7%和28.0%。成功分离了29条甲基化修饰DNA序列,通过测序发现有22条能够得到桃基因组支持且同源性较高,其中2条来自于类胡萝卜素裂解双加氧酶4(CCD4)、3条来自于Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶;推测CCD4和Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶可能与叶色嵌合突变有关。

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