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细粒棘球绦虫原头蚴lncRNA表达谱分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王正荣 1 ; 张艳艳 1 ; 马勋 1 ; 刘乙 1 ; 徐梦飞 1 ; 孟季蒙 1 ; 薄新文 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院畜牧兽医研究所省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

关键词: 细粒棘球绦虫;lncRNA;原头蚴;表达谱

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2019 年 009 期

页码: 1864-1873

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在解析lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴中的表达谱特性,为进一步揭示lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴发育中的作用及调控机制提供理论依据.从患病绵羊肝无菌采集细粒棘球绦虫原头蚴,提取总RNA,构建原头蚴lncRNA文库,利用RNA sequencing技术进行测序分析.结果表明,首次从细粒棘球绦虫原头蚴中鉴定出609个新的lncRNA分子.其中intergenic lncRNA有431个,intronic lncRNA有11个,anti-sense lncRNA有68个,sence lncRNA有99个.GO分析表明,其表达量前200的lncRNA分子主要与MAP激酶的负调控、SMC结合复合物、IMP的生物合成以及乙酰转移酶激活剂活性相关.KEGG分析结果表明,其表达量前200的lncRNA分子主要与细胞凋亡、萜类骨架生物合成、碳代谢以及背腹轴形成相关.cis分析结果表明,在这609个新的lncRNA分子中,与虫体Wnt信号通路、Hedgehog信号通路、NF-κB信号通路、cAMP信号通路、Notch信号通路、胆酸盐信号通路以及背腹轴信号通路相关的lncRNA分子分别有79、31、10、128、43、84和73个.qRT-PCR的验证结果表明,表达量前10的lncRNA分子与测序结果一致.RNA荧光探针原位杂交结果表明,高表达的lncRNA分子在细粒棘球绦虫原头蚴吸盘以及表皮均有表达.综上所述,本研究首次解析了细粒棘球绦虫原头蚴中lncRNA的表达谱特性,丰富了细粒棘球绦虫lncRNA的数据,为进一步解析lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴发育中的作用奠定了基础.

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