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玉米SSR标记DNA指纹数据库中N+1峰的消除

文献类型： 中文期刊

作者： 薛宁宁 1 ; 许理文 1 ; 易红梅 1 ; 葛建镕 1 ; 王凤格 1 ; 陆大雷 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院玉米研究中心玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室;扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室

关键词： N+1峰;SSR标记;DNA指纹数据库

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 965-973

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为解决玉米SSR标记DNA指纹数据库构建时,N+1峰带来的指纹数据标准化采集问题,本研究对40个玉米品种鉴定核心引物进行评估,其中13对引物的扩增产物产生N+1峰。对于这些引物,通过增加PCR程序最后一步的延伸时间和下游引物5'端加一个G(鸟嘌呤)两种方法进行N+1峰的消除。结果表明:与标准中提供的程序和引物序列相比,将PCR程序最后一步的延伸时间增加至90 min,消除了9对引物扩增产物的N+1峰,下游引物5'端加一个G能消除12对引物扩增产物的N+1峰。最终提出两种消除N+1峰的方案,均能有效改善玉米标准DNA指纹数据库的图谱质量。

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