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椰子织蛾转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐志文 1 ; 任雪敏 1 ; 王俊 1 ; 张枝全 1 ; 刘乃勇 1 ; 阎伟 1 ; 朱家颖 1 ;

作者机构： 1.西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室;中国热带农业科学院椰子研究所

关键词： 椰子织蛾;转录组;基因;功能注释

期刊名称： 西南林业大学学报(自然科学)

ISSN： 2095-1914

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 38-45

收录情况： 北大核心

摘要： 为获取入侵性检疫害虫椰子织蛾的基因信息,利用高通量测序技术对该害虫进行了转录组测序。结果表明:经拼接共获得了37 416条unigenes,平均长度为803 bp,N50为1 415 bp;通过BlastX比对,有19 154条unigenes (51.19%)成功在Nr中被注释。在Nr中成功注释的unigene,与黑脉金斑蝶同源性最高,达到68.45%;在GO注释中,共有14 131 (37.76%)条unigenes被成功注释到细胞组分、分子功能和生物过程3大类的54个分支;在COG数据库中,成功注释的8 606条unigenes被注释到26个分类;在KEGG中,共有6 171条(16.49%) unigenes被注释到5大类通路的260条途径上。基于构建的转录组数据库,鉴定得到3 248个微卫星。

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