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基于SLAF-seq技术的山西省地方梨品种的SNP分析

文献类型： 中文期刊

作者： 白牡丹 1 ; 郝国伟 1 ; 张晓伟 1 ; 杨盛 1 ; 郭黄萍 1 ;

作者机构： 1.山西省农业科学院果树研究所

关键词： 梨;SLAF-seq;SNP;群体结构;进化树

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2020 年 29 卷 007 期

页码： 1020-1027

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用简化基因组测序技术SLAF-seq测序对30个山西省地方梨品种群体结构与亲缘关系进行分析,旨在为梨育种及其资源利用提供参考.通过序列分析,获得603 177个SLAF标签,其中多态性的SLAF标签302 703个,共得到2 140 079个群体SNP.利用这些SNP标签分析可得30个梨品种可以分为两大类.通过构建进化树发现,‘金梨’与‘大黄梨’虽田间性状比较相似,但在进化树上显示两者亲缘关系较远,可以断定二者为不同梨品种.

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