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葫芦科作物基因组学研究进展

文献类型: 中文期刊

作者: 江彪 1 ; 闫晋强 1 ; 晏石娟 1 ; 谢大森 1 ; 刘文睿 1 ; 王敏 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室;广东省农业科学院农业生物基因研究中心

关键词: 葫芦科作物;基因组;全基因组测序;物种进化;农艺性状;基因挖掘

期刊名称: 广东农业科学

ISSN: 1004-874X

年卷期: 2023 年 50 卷 04 期

页码: 1-13

摘要: 葫芦科拥有许多常见的蔬菜和瓜果,在农业生产和人民生活中占有举足轻重的地位。高质量参考基因组是重要农艺性状相关基因挖掘、种质资源精准鉴评及分子设计育种体系建立及应用的重要前提。随着测序技术的快速发展,陆续建立了Sanger、Roche 454、Illumina、PacBio等测序平台,测序成本不断降低,不同物种的基因组测序工作陆续完成。黄瓜是葫芦科作物研究的模式作物,是第一个完成基因组测序的蔬菜作物。随后,包括西瓜、甜瓜、南瓜和冬瓜等在内的葫芦科作物逐步完成了全基因组测序,显著提升了葫芦科作物的基因组学、系统进化和分子生物学研究水平。本文综述了葫芦科主要作物在全基因组测序方面取得的一系列重要进展,全基因组测序工作在葫芦科作物起源与进化、重要农艺性状相关基因挖掘等方面的实际应用情况,并对葫芦科作物端粒到端粒(T2T)基因组和泛基因组的构建进行了展望。

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