您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析

文献类型: 中文期刊

作者: 蒋智勇 1 ; 周霞 1 ; 李春玲 1 ; 楚品品 1 ; 勾红潮 1 ; 李艳 1 ; 卞志标 1 ; 刘建营 2 ; 翟少伦 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院动物卫生研究所猪病研究室/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站

2.广东省农业技术推广中心

关键词: D型流感病毒;谱系;HEF蛋白;N-糖基化位点;B细胞表位;预测

期刊名称: 中国动物保健

ISSN: 1008-4754

年卷期: 2024 年 26 卷 010 期

页码: 123-128

摘要: D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性.基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为 5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/CA2019谱系.不同于甲型、乙型流感病毒,IDV的潜在N-糖基化位点主要集中分布在HEF基因上.为系统了解不同谱系毒株HEF蛋白的N-糖基化位点和B细胞表位,从GenBank数据库获得 151条全长HEF基因序列,通过使用MEGA-X生物信息学软件构建遗传进化树,并用在线工具进行各毒株N-糖基化位点和线性B细胞表位预测分析.结果表明IDV的HEF蛋白具有6~8个潜在的N-糖基化位点,其中有2个N-糖基化位点(N146和N613)在不同谱系间相同,有6个N-糖基化位点(N28、N54、N249、N346、N390和N513)在不同谱系间存在差异.B细胞表位在不同谱系间有 3个保守的表位和 8~9个各谱系独特的表位.线性B细胞表位的预测将有助于设计激活体液反应的多表位疫苗,预测结果还需要体外和体内实验证实来证明该应用的可行性.

  • 相关文献

[1]抗原表位研究方法进展. 宋帅,李春玲,贾爱卿,杨冬霞,李淼. 2010

[2]北京鸭呼肠孤病毒σA、σB蛋白的二级结构及B细胞抗原表位的预测. 刘红,樊惠英,朱朝辉,罗琼,吴志新,廖明. 2009

[3]锦鲤疱疹病毒囊膜蛋白ORF59的克隆、分析及其主要B细胞表位区的原核表达. 柯浩,刘振兴,林敏,孟轩,陈棠堂. 2010

[4]一株高病毒载量PCV2毒株的基因组特征及序列分析. 常鑫,蒋智勇,卞志标,徐民生,杨冬霞,杨傲冰,翟少伦. 2024

[5]锦鲤疱疹病毒囊膜蛋白ORF132的克隆及分析. 刘振兴,柯浩,孟轩,林敏,陈棠堂,颜远义. 2011

[6]广东省蔬菜生产与市场需求预测研究. 邱俊荣,左小德,刘炜,朱碧岩. 2000

[7]广东化肥零售价格波动规律与趋势预测. 刘一锋,马力,曾招兵,汤建东,张满红. 2015

[8]中国森林生物多样性动态的灰色预测. 王本洋,罗富和,甄学宁,余世孝. 2007

[9]黄毛鼠种群动态的时序组合预测模型研究. 冯志勇,黄立胜,邱俊荣,隋晶晶,姚丹丹,黄秀清. 2006

[10]荔枝蒂蛀虫发生规律及生活习性观察研究. 李志强,邱燕萍,欧良喜,陈洁珍,向旭,孙清明. 2008

[11]基于MaxEnt的入侵植物刺轴含羞草的适生分布区预测. 岳茂峰,冯莉,田兴山,杨彩宏. 2013

[12]广东省微生物肥料的回顾和展望. 高云超,陈俊秋,张孝祺. 2001

[13]基于MaxEnt的截获秀粉蚧潜在地理分布预测. 奚国华,齐国君,王书平,刘军义,梁琨,李惠苹,吴福中. 2017

[14]2012年广东生猪产业发展形势与对策建议. 马力,郑业鲁,林群,万忠,刘小红,马巍. 2013

[15]分子标记预测作物杂种优势的研究进展. 任羽,王得元,张银东. 2004

[16]广东省主要农产品消费需求现状、趋势与对策. 方伟,杨震宇,万忠,林伟君,罗军. 2016

[17]基于MaxEnt模型的入侵植物白花鬼针草的分布预测及适生性分析. 岳茂峰,冯莉,崔烨,张纯,田兴山. 2016

作者其他论文 更多>>