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识别杜洛克猪个体身份的DNA条形码

文献类型: 中文期刊

作者: 丁潜 1 ; 邢光东 2 ; 胡肄农 3 ; 纪红军 1 ; 赵庆顺 4 ; 徐银学 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学动物科技学院

2.江苏省农业科学院畜牧研究所

3.江苏省农业科学院兽医研究所

4.南京大学模式动物研究所

关键词: 杜洛克猪;个体身份识别;DNA条形码

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2014 年 05 期

页码: 1058-1063

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了对杜洛克猪个体身份进行DNA识别,从31对PCR引物中筛选到了8对引物可高效扩增猪基因组片段并获得39个SNP位点,从39个SNP位点中选留杂合度H≥0.1的16个SNP位点,用于编制杜洛克猪个体身份识别的DNA条形码及相应的数字条形码。结果表明,编制的DNA条形码或相应的数字条形码很好地区分了10窝共计68头杜洛克猪个体身份。从这68个样本中,8对引物分离的基因型种类分别是2、10、9、3、3、9、3、3种;理论上这8对引物分离到的这些基因型可有2×10×9×3×3×9×3×3种组合,即可用于131 220头杜洛克猪的个体身份识别。因此,根据筛选的8对引物扩增的16个SNP位点编制的DNA条形码或相应的数字条形码,足以满足规模种猪场杜洛克猪的个体身份识别。

  • 相关文献

[1]苏钟猪个体身份SNP识别的数字条形码编制. 胡肄农,丁潜,纪红军,王晓晓,朱振坤,赵庆顺,邢光东. 2014

[2]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究-以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

[3]DNA条形码专用R包及其主要功能简介. 金倩,阮倩倩,陈芬,罗桂杰,张爱兵. 2017

[4]DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定. 陈亚辉,朱海军,生静雅,张普娟,鲍瑾,刘广勤. 2013

[5]基于DNA条形码的物种丰富度估计:以宿迁地区鳞翅目蛾类为例. 金倩,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,王昊,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2016

[6]青藏高原地区不同环境条件下鳞翅目昆虫物种多样性与系统发育多样性的初步研究. 金倩,阮倩倩,陈芬,刘博,蔡卫佳,张爱兵. 2018

[7]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

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