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甜玉米胚乳突变基因shrunken2的序列变异解析

文献类型： 中文期刊

作者： 索海翠 1 ; 郑锦荣 2 ; 张小兰 2 ; 李智军 3 ; 李武 2 ;

作者机构： 1.广东省农科院作物研究所广东金作农业科技有限公司

2.广东省农科院作物研究所

3.广东省农科集团良种苗木中心

关键词： 甜玉米;Shrunken2;序列多态性;中性检测;单倍型

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 05 期

页码： 1049-1058

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Shrunken2基因编码葡萄糖焦磷酸化酶的大亚基,是玉米淀粉合成途径中的限速酶,shrunken2是Shrunken2的隐性突变等位基因,对甜玉米品质和风味的形成起着重要的作用。本研究以玉米B73的Shrunken2基因为参考序列,在58份甜玉米自交系中进行shrunken2基因的重测序,共获得了7 635 bp的核苷酸序列,涵盖了20个外显子,17个内含子以及3'UTR区域。基因多态性分析发现,在供试群体中共有多态性位点105个,包括78个SNP和27个Indel。与普通玉米B73的Shrunken2序列之间存在58个多态性位点差异,包括50个SNP和8个Indel,其中位于编码区的SNP位点包含2个同义突变和7个非同义突变。根据shrunken2基因全长序列和编码区序列可将该群体分成14种和4种单倍型。中性检测表明该基因经历了自然和人工双重选择过程。

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