您好,欢迎访问黑龙江省农业科学院 机构知识库!

大豆GmEXPB3和GmEXPB6生物信息学分析及干旱和盐胁迫诱导表达

文献类型: 中文期刊

作者: 李佳欣 1 ; 孙莹莹 1 ; 邓雅文 1 ; 轩称心 1 ; 马志强 1 ; 马洪宇 1 ; 张军 2 ; 翟莹 1 ;

作者机构: 1.齐齐哈尔大学生命科学与农林学院

2.黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院

关键词: 大豆;膨胀素;EXPB;生物信息学分析;非生物胁迫;表达分析

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2024 年 43 卷 005 期

页码: 559-564

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 膨胀素(Expansin, EXP)通过调控细胞壁的松弛在植物应对环境胁迫过程中起着重要作用。为研究EXP基因在大豆应对干旱和盐胁迫过程中的作用,本研究对大豆中的两个EXP基因(GmEXPB3和GmEXPB6)进行生物信息学分析,通过实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)检测基因干旱和盐胁迫后的表达量。结果表明:GmEXPB3和GmEXPB6基因分别位于大豆第3和11号染色体上,编码的蛋白序列长度分别为267和277个氨基酸。GmEXPB3蛋白分子量为28.81 kDa,理论等电点为5.62;GmEXPB6蛋白分子量为29.37 kDa,理论等电点为4.95。GmEXPB3和GmEXPB6均为不稳定的亲水蛋白且定位于细胞壁中。GmEXPB3和GmEXPB6蛋白均含有1个保守的DPBB_1结构域。GmEXPB3蛋白与小麦TaEXPB10蛋白的亲缘关系最近,GmEXPB6蛋白与GmEXPB2蛋白亲缘关系最近。干旱胁迫能够诱导GmEXPB3的表达,但不能诱导GmEXPB6的表达。盐胁迫能够诱导GmEXPB3和GmEXPB6的表达。GmEXPB3的启动子区域含有5种与逆境有关的顺式作用元件,GmEXPB6的启动子区域含有4种与逆境有关的顺式作用元件。研究结果可为大豆EXPB基因抗逆机制的研究及应用提供理论依据。

  • 相关文献

[1]大豆中3个Dof转录因子的生物信息学及表达分析. 翟莹,邱爽,张军,刘春雨,赵艳,李珊珊,张梅娟,邱增城,任巍巍. 2019

[2]2个大豆VOZ转录因子的克隆及非生物胁迫表达分析. 邬长乐,张军,何佳琦,李铭杨,于海伟,李珊珊,翟莹. 2022

[3]大豆转录因子基因GmDof3的克隆及非生物胁迫诱导表达分析. 翟莹,何佳琦,张军,邱爽,赵艳,张梅娟,马天意,孙天国. 2020

[4]大豆转录因子GmDof1.5的克隆与非生物胁迫诱导表达. 何佳琦,翟莹,张军,邱爽,李铭杨,赵艳,张梅娟,马天意. 2021

[5]大豆GmDFR基因克隆及其抵御缺铁胁迫功能的鉴定. 石卓,李洪,高铭,郭长虹,郭东林,毕影东. 2023

[6]蒜芥茄SsUBC基因的克隆及表达分析. 董轩名,蔡佳文,郑妍,于丽杰,肖玮,金晓霞,董延龙. 2018

[7]非生物胁迫诱导的GmMYB基因克隆与表达分析. 孙霞,刘晋跃,袁晓辉,潘相文,杜维广,任海祥,马永波,JunABE,邱丽娟,刘宝辉. 2012

[8]非生物胁迫诱导的GmMYB基因克隆与表达分析. 孙霞,刘晋跃,袁晓辉,潘相文,杜维广,任海祥,马永波,JunABE,邱丽娟,刘宝辉. 2011

[9]龙葵E2泛素结合酶基因SorUBC克隆及表达特性分析. 蔡佳文,金晓霞,于丽杰,崔柏杨,魏迅,董延龙. 2016

[10]大豆GmCBL7-2生物信息学及非生物胁迫表达分析. 陈炯辛,张军,马婷婷,李铭杨,于海伟,李珊珊,兰红宇,翟莹. 2022

[11]大豆耐盐碱鉴定池pH调节的初步研究. 韩德志,孙浩峰,冯丽艳,张雷,贾鸿昌,闫晓飞,鹿文成. 2023

[12]大豆肌醇半乳糖苷合成酶基因GmGolS克隆及非生物胁迫表达分析. 邱爽,张军,何佳琦,周雨明,李铭杨,翟莹. 2021

[13]异源表达大豆转录因子GmNF-YA19提高转基因烟草抗旱性. 翟莹,李铭杨,张军,赵旭,于海伟,李珊珊,赵艳,张梅娟,孙天国. 2023

[14]大豆GmDof4和GmDof11基因的非生物胁迫诱导表达及启动子分析. 张军,尹珺伊,何佳琦,田秋丰,刘秋瑾,王岩,史同瑞,翟莹. 2021

[15]大豆GmNCED1-2的非生物胁迫诱导表达及其转基因烟草鉴定. 于海伟,李铭杨,张军,李珊珊,张梅娟,马天意,赵艳,兰红宇,翟莹. 2023

[16]大豆核因子GmNF-YA13基因的克隆及功能分析. 翟莹,李铭杨,张军,于海伟,李珊珊,孙天国,赵艳,兰红宇. 2023

[17]大豆GmNIC1基因克隆及非生物胁迫应答分析. 张琦,刘兴宇,任馨原,刘雅心,隋京芮,严红静,赵晓菊,徐杰飞. 2024

[18]大豆GeBP转录因子家族基因生物信息学分析. 张军,尹珺伊,王岩,田秋丰,刘秋瑾,何佳琦,黄宇翔,王丽坤,史同瑞,翟莹. 2021

[19]大豆核孔蛋白GmNup96基因的克隆及生物信息学分析. 纪丹丹,肖龙,孙培元,刘春燕,傅永福,陈庆山. 2016

[20]大豆E3泛素连接酶基因GmAIRP1的同源克隆及在烟草中的功能鉴定. 张雅文,沈祥娟,张静,朱美娇,张海玲,王全伟. 2019

作者其他论文 更多>>