文献类型： 中文期刊

作者： 黎玉琼 ¹ ; 郜军荣 ² ; 刘芸芸 ³ ; 李红兵 ³ ; 高海慧 ¹ ; 赵正伟 ¹ ; 于有利 ¹ ; 牛晓昊 ¹ ;

作者机构： 1.宁夏农林科学院动物科学研究所

2.固原原州区畜牧技术推广服务中心

3.宁夏农垦贺兰山奶业有限公司

关键词： 宁夏地区;贾第鞭毛虫;奶牛;β-贾第素;巢式PCR;粪便样品

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 020 期

页码： 83-88

收录情况： 北大核心

摘要： 为了明确宁夏地区奶牛贾第鞭毛虫的优势基因型及其流行特征，试验首先于宁夏地区10个规模化奶牛养殖场采集880份奶牛粪便样品，针对贾第鞭毛虫保守基因——β-贾第素（β-giardin, βg）基因序列设计引物，然后以提取的粪便样品全基因组DNA为模板进行巢式PCR,将PCR产物的测序结果进行BLAST比对分析，鉴定贾第鞭毛虫的基因型，并建立系统进化树，最后对宁夏地区不同城市、不同月龄及腹泻和非腹泻奶牛粪便样品的感染阳性率和基因型进行统计。结果表明：880份粪便样品中，有145份样品扩增到大小为510 bp的条带，贾第鞭毛虫感染阳性率为16.5%（145/880）,其中集聚体A的占比为1.4%（2/145）,集聚体E的占比为98.6%（143/145）;所有集聚体A的βg基因为1种序列（已上传至GenBank,登录号为OQ101261 1NX）,所有集聚体E的βg基因为4种序列（已上传至GenBank,登录号分别为OQ101262 2NX、OQ101263 3NX、OQ101264 4NX和OQ101265 5NX）;OQ101261 1NX（奶牛）与MK5773339.1（藏牛）、MF497409.1（麝香鹿）和LC437420.1（犬）等在同一分支上；OQ101262 2NX（奶牛）、OQ101263 3NX（奶牛）、OQ101264 4NX（奶牛）与MK862313.1（马）、KR0755939.1（绵羊）、MK610388.1（滩羊）等在同一分支上；OQ101265 5NX（奶牛）与KJ188047.1（奶牛）、KJ188056.1（奶牛）、MK5773337.1（藏牛）在同一分支上。宁夏地区四个城市奶牛贾第鞭毛虫感染阳性率表现为中卫市（50.0%,8/16）＞银川市（16.3%,126/772）＞吴忠市（14.3%, 9/63）＞石嘴山市（6.9%, 2/29）;仅在银川市同时检测出集聚体A（1.6%,2/126）和集聚体E（98.4%,124/126）,在中卫市、石嘴山市和吴忠市均仅检测出集聚体E;不同月龄奶牛贾第鞭毛虫感染阳性率表现为3～4月龄（26.5%,30/113）＞0～2月龄（23.3%,53/227）＞5～7月龄（17.4%,49/282）＞12月龄以上（6.9%,13/189）＞8～12月龄（0,0/69）,仅在5～7月龄奶牛粪便中同时检测出集聚体A（4.1%,2/49）和集聚体E（95.9%,47/49）,其他月龄段均仅检测出集聚体E;腹泻样品中贾第鞭毛虫感染阳性率为23.6%（37/157）,非腹泻样品中贾第鞭毛虫感染阳性率为14.9%（108/723）,腹泻样品中集聚体A和集聚体E的占比分别为2.7%（1/37）和97.3%（36/37）,非腹泻样品中集聚体A和集聚体E的占比分别为0.9%（1/108）和99.1%（107/108）。说明宁夏地区奶牛存在第鞭毛虫感染，集聚体E为优势基因型。