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谷子SBP转录因子家族基因的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杜晓芬 1 ; 韩康妮 1 ; 李禹欣 1 ; 王智兰 1 ; 连世超 1 ; 王军 1 ;

作者机构: 1.山西农业大学谷子研究所杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室

关键词: 谷子;SBP转录因子;表达分析;生物信息学分析;荧光实时定量分析

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2021 年 012 期

页码: 1474-1482

摘要: SBP(Squamosa promoter binding protein)是植物中一类特有的转录因子,在调控株型建成、开花、产量、激素信号转导、逆境响应等方面发挥重要作用。为探究谷子SBP家族基因的表达模式,利用生物信息学和荧光实时定量PCR,对19个SiSBPs在不同组织器官中的表达模式进行了分析,并对其启动子顺式作用元件进行预测,进一步分析了7个SiSBPs对3种植物激素和3种逆境胁迫的响应规律;同时,利用ps RNATarget server对miR156和miR529的靶基因结合位点进行了预测。结果表明,SiSBP17总体表达水平低于其他基因,SiSBP19表现为组成型表达,其余SiSBPs表现出明显的组织表达特异性;7个SiSBPs对生长素、赤霉素、茉莉酸甲酯等外源植物激素和ABA、冷、干旱等胁迫处理均有响应,不同基因在不同激素和逆境胁迫下的响应规律存在差异;另外,研究预测到13个SiSBPs存在miR156和miR529结合位点。

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