您好,欢迎访问山西省农业科学院 机构知识库!

谷子SBP转录因子家族基因的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杜晓芬 1 ; 韩康妮 1 ; 李禹欣 1 ; 王智兰 1 ; 连世超 1 ; 王军 1 ;

作者机构: 1.山西农业大学谷子研究所杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室

关键词: 谷子;SBP转录因子;表达分析;生物信息学分析;荧光实时定量分析

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2021 年 012 期

页码: 1474-1482

摘要: SBP(Squamosa promoter binding protein)是植物中一类特有的转录因子,在调控株型建成、开花、产量、激素信号转导、逆境响应等方面发挥重要作用。为探究谷子SBP家族基因的表达模式,利用生物信息学和荧光实时定量PCR,对19个SiSBPs在不同组织器官中的表达模式进行了分析,并对其启动子顺式作用元件进行预测,进一步分析了7个SiSBPs对3种植物激素和3种逆境胁迫的响应规律;同时,利用ps RNATarget server对miR156和miR529的靶基因结合位点进行了预测。结果表明,SiSBP17总体表达水平低于其他基因,SiSBP19表现为组成型表达,其余SiSBPs表现出明显的组织表达特异性;7个SiSBPs对生长素、赤霉素、茉莉酸甲酯等外源植物激素和ABA、冷、干旱等胁迫处理均有响应,不同基因在不同激素和逆境胁迫下的响应规律存在差异;另外,研究预测到13个SiSBPs存在miR156和miR529结合位点。

  • 相关文献

[1]谷子ABC转运蛋白基因与抗旱关系的研究. 张瑞杰,王喆,连卜颖,郭展,魏东,于世慧,李红英,刘晓东. 2018

[2]谷子Aux/IAA家族基因干旱胁迫响应表达模式分析. 刘晶,王俊杰,程璐,陈利青,禾璐,候蕊,韩渊怀. 2017

[3]谷子SiARGOS1的克隆、表达分析和功能标记开发. 王智兰,杜晓芬,王军,杨慧卿,王兴春,郭二虎,王玉文,袁峰,田岗,刘鑫,王秋兰,李会霞,张林义,彭书忠. 2017

[4]谷子PEPC基因的鉴定及其对非生物逆境的响应特性. 赵晋锋,杜艳伟,王高鸿,李颜方,赵根有,王振华,王玉文,余爱丽. 2020

[5]SiASRs家族基因的鉴定及表达分析. 宋健,曹晓宁,王海岗,陈凌,王君杰,刘思辰,乔治军. 2019

[6]谷子GRAS转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及标记开发. 王智兰,韩康妮,杜晓芬,李禹欣,连世超,王军. 2022

[7]枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建. 郝子琪,许洪仙,孟玉平,曹冬梅,曹秋芬. 2011

[8]苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析. 侯思宇,赵盖超,刘荣华,孙朝霞,令狐斌,韩渊怀,许冬梅,李红英. 2015

[9]苦荞C4H基因的cDNA克隆及生物信息学分析. 刘荣华,王丽,孙朝霞,侯思宇,李红英. 2017

[10]糜子抗白粉病基因(Mlo)编码蛋白的序列特征及表达分析. 石甜甜,何杰丽,秦明月,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2018

[11]棉花转录因子基因GhMYBPA1的克隆及表达分析. 张安红,赵战胜,王志安,肖娟丽,刘圆,罗晓丽. 2020

[12]谷子TCP基因家族成员序列特征及表达模式分析. 连卜颍,王喆,韩尚玲,侯思宇,韩渊怀,李红英. 2020

[13]高粱WRKY家族成员鉴定及生物信息学分析. 赵兴奎,范昕琦,聂萌恩,王海燕,柳青山,段永红. 2020

[14]中华蜜蜂离子型受体AcerIR76b、AcerIR75f.1生物信息学和差异表达分析. 冯宇佳,杜亚丽,赵慧婷,马卫华,刘晋佳,马秀梅,张宇昊,姜玉锁. 2020

[15]枣树水通道蛋白基因生物信息学分析及原核表达载体的构建. 张洁,杨大威,孟玉平,赵玉云,曹秋芬. 2010

[16]玉米谷胱甘肽过氧化物酶生物信息学分析. 张媛,张钟仁,咸丽霞,邢国芳. 2013

[17]燕麦核不育雄蕊转录组测序及分析. 张丽君,刘龙龙,乔治军,马名川,周建萍,范银燕,崔林. 2014

[18]枣树2-半胱氨酸氧化还原酶基因Zj2-CP的生物信息学分析及表达载体的构建. 罗慧珍,邓舒,肖蓉,张春芬,任莹,郭慧娜,孟玉平,曹秋芬. 2015

[19]谷子(粟)蛋白质品质及其优化栽培. 马建萍,古兆明,古世禄,吕建珍. 2009

[20]烯效唑对谷子生长发育及生理特性的影响. 马建萍,古世禄,独俊娥,刘子坚. 1999

作者其他论文 更多>>