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一株H4亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传演化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘丽玲 1 ; 李雁冰 2 ; 张翼 2 ; 段振华 2 ; 施建忠 2 ; 田国彬 2 ; 曾显营 2 ; 刘娣 1 ; 华育平 3 ; 陈化兰 2 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院

2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室

3.东北林业大学

关键词: 禽流感病毒;H4亚型;遗传演化分析

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2011 年 33 卷 03 期

页码: 185-188

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 2008年对我国南方活禽市场进行流行病学监测时从鸭体内分离鉴定一株H4亚型禽流感病毒(AIV),命名为A/duck/Guangxi/912/2008(H4N2)(缩写为DK/GX/912/08)。为了解该株H4亚型AIV的来源、特征及其分子演化规律,本研究对其全基因序列进行测定,并与GenBank登录的相关病毒进行遗传演化分析。结果表明:DK/GX/912/08HA基因切割位点附近的氨基酸序列(PEKASR↓GLF)符合低致病力AIV的特征,其分子遗传演化关系属于东半球谱系的欧亚分支;NA基因与A/duck/Jiangxi/1286/2005(H5N2)在同一分支内,核苷酸同源性为98.1%;PB2基因与A/duck/Nanchang/4-165/2000(H4N6)处于同一分支;而NS基因与A/duck/Jiangxi/1786/03(H7N7)同源性最高。因此,推测DK/GX/912/08可能是不同来源的基因在鸭体内经过复杂重组演变的一株重组病毒。

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