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西瓜SOD家族基因的鉴定及其对枯萎病菌的响应特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 何艳军 1 ; 孙玉燕 1 ; 李丽莉 1 ; 姚依秀 1 ; 郭平安 1 ; 高杰 1 ; 范敏 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所;新疆农业大学林学与园艺学院

关键词: 超氧化物歧化酶(SOD);进化分析;基因表达;西瓜;枯萎病

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2020 年 018 期

页码: 5883-5893

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 西瓜作为一种重要的园艺作物,极易受到逆境尤其是各种病原菌的侵害,在生产上造成严重的损失.逆境胁迫会诱导植物细胞内活性氧自由基的积累,产生氧化胁迫,影响植物的生长发育.超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)是抗氧化系统的第一道防线,能有效清除活性氧,减轻氧化胁迫从而提高植物对逆境的耐受能力,但还没有研究对西瓜SOD基因进行分离和鉴定.本研究采用生物信息学手段在西瓜基因组中共鉴定到8条ClSOD基因,并对它们基因结构、进化关系、蛋白结构、亚细胞定位、启动子顺式作用原件及表达模式等进行预测和分析.根据蛋白结构和进化分析表明,西瓜SOD蛋白可分为Cu/ZnSODs和Fe-MnSODs两类,进一步分为4个亚族.绝大多数西瓜SOD基因含有多个内含子.利用荧光定量PCR(qRT-PCR)分析发现,西瓜SOD基因具有不同的的时空表达模式.另外,我们从ClSOD基因的启动子上鉴定到许多激素和逆境相关的顺式作用元件.接种尖孢镰刀杆菌后,西瓜抗病品种中大部分SOD基因的表达上调而感病品种中则相反,初步鉴定到一些与枯萎病抗性相关的ClSOD基因.本研究将为西瓜抗病基因的功能鉴定及其调控机理的探究提供科学依据,也为西瓜抗病分子育种提供理论基础.

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