文献类型： 中文期刊

作者： 房永雨 ¹ ; 郝丽芬 ¹ ; 聂利珍 ¹ ; 丁海君 ¹ ; 王力伟 ¹ ; 赵小庆 ¹ ; 孙杰 ¹ ; 史志丹 ¹ ; 何江峰 ¹ ;

作者机构： 1.内蒙古自治区农牧业科学院

关键词： 沙拐枣;CmBADH基因;RACE克隆;生物信息学分析

期刊名称： 北方农业学报

ISSN： 1007-0907

年卷期： 2020 年 003 期

页码： 32-38

摘要： [目的]揭示抗逆植物沙拐枣甜菜碱醛脱氢酶(CmBADH)的基因序列.[方法]利用RACE技术克隆CmBADH基因的全长序列,并对其基因序列和蛋白序列进行生物信息学分析.[结果]CmBADH基因的cDNA全长1 863 bp,开放阅读框(ORF)全长1 506 bp,编码501个氨基酸.通过Blastn比对,发现CmBADH与海马齿(Sesuvium portulacastrum)、山谷栎(Quercus lobata)、盐爪爪(Kalidium foliatum)的BADH相似性分别达到80.04%、79.97%、79.55%.其相对分子量为123.46 kDa,等电点(pI)5.01,蛋白序列共有16个磷酸化位点;不含有跨膜结构域;不含有信号肽位点;含有一个甜菜碱醛脱氢酶结构域(PLN02467).二级结构显示α螺旋占43.31%,无规则卷曲占31.94%,延伸链占17.37%,β转角占7.38%.三级结构模型为椭球形.[结论]沙拐枣CmBADH基因序列的确定,为今后研究沙拐枣CmBADH基因的抗逆功能提供研究基础.