您好,欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库!

基于Hsp70基因的绵羊肺炎支原体TaqMan检测方法的建立及其遗传演化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 江锦秀 1 ; 张靖鹏 1 ; 林裕胜 1 ; 刘维巍 2 ; 胡奇林 1 ; 万春和 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)

关键词: 绵羊肺炎支原体;Hsp70基因;TaqMan实时荧光定量PCR方法;序列分析

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 1684-1695

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 热休克蛋白70 (heat shock protein 70,Hsp70)是绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae, Movi)的重要膜蛋白,是机体内高度保守的生物分子,但在种间差异大,可作为分子生物学检测的候选靶区。为建立基于Hsp70基因的Movi通用型TaqMan实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法,并进一步了解其遗传变异情况,本研究基于GenBank中Movi的Hsp70基因特征,设计特异性的引物及探针,建立了基于Hsp70基因的绵羊肺炎支原体qPCR检测方法。应用建立的检测方法对88份山羊鼻拭子样品及43份疑似羊支原体性肺炎(Mycoplasmal pneumonia of sheep and goats, MPSG)病料进行检测。将检测结果为Movi阳性的肺组织样品进行分离鉴定,并对分离株Hsp70基因进行序列分析。结果显示,建立的qPCR检测方法其相关系数为1.00,扩增效率为96.0%,斜率为-3.411,Y轴截距为37.29。特异性强,与丝状支原体山羊亚种(Mycoplasma mycoides subsp.capri, Mmc)、山羊支原体山羊肺炎亚种(Mycoplasma capricolum subsp.capripneumoniae, Mccp)、莱氏无胆甾原体(Acholeplasmalaidlawii, AL)、无乳支原体(Mycoplasma agalactiae, Maga)、伪结核棒状杆菌(Corynebacterium pseudotuberculosis, CP)、羊口疮病毒(orf virus, ORFV)、牛支原体(Mycoplasma bovis, Mb)等牛羊常见病原均无交叉反应;敏感性高,最低检测限为5.72 copies·μL-1;重复性优,组内变异系数和组间变异系数均小于1.00%。6株Movi分离株Hsp70基因全长均为1 818 bp,与其它Movi参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为96.0%~99.4%和98.0%~100.0%;进一步分析发现,山羊源Movi均比绵羊源多1个N-糖基化位点。遗传演化分析表明,其均处于ClusterⅠA亚分支(均为山羊源)。综上,本研究建立了特异性强、敏感性高、重复性优的基于Hsp70基因的Movi的qPCR检测方法。序列分析发现,不同来源Movi的Hsp70基因核苷酸同源性高;遗传演化分析证实,Movi福建株与山羊源分离株遗传关系较近。本研究不仅为Movi临床诊断提供了技术支持,更为进一步了解Movi遗传演化规律提供参考。

  • 相关文献

[1]猪圆环病毒3型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立. 陈如敬,吴学敏,陈秋勇,车勇良,王隆柏,严山,周伦江. 2020

[2]绵羊肺炎支原体FJ01-CL株的分离和鉴定. 江锦秀,林甦,林裕胜,江斌,胡奇林. 2015

[3]绵羊肺炎支原体TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立. 林裕胜,江锦秀,张靖鹏,游伟,胡奇林. 2018

[4]绵羊肺炎支原体和山羊伪结核棒状杆菌双重PCR检测方法的建立及应用. 黄丽丽,林裕胜,肖义军,胡奇林. 2020

[5]福清市福清山羊绵羊肺炎支原体血清学调查. 郭慧瑜,林裕胜,毛坤明,胡奇林. 2019

[6]绵羊肺炎支原体、丝状支原体山羊亚种和山羊支原体山羊肺炎亚种多重PCR检测方法的建立. 林裕胜,江锦秀,江斌,游伟,胡奇林. 2018

[7]绵羊肺炎支原体感染的诊断和防治技术研究进展. 江锦秀,林裕胜,张靖鹏,游伟,黄丽丽,胡奇林. 2019

[8]绵羊肺炎支原体和丝状支原体山羊亚种双重TaqMan探针荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 林裕胜,李莎莎,江锦秀,张靖鹏,游伟,胡奇林. 2019

[9]绵羊肺炎支原体FJ01-CL株的分离和鉴定. 江锦秀,林甦,林裕胜,江斌,胡奇林. 2015

[10]绵羊肺炎支原体RPA检测技术的建立. 林裕胜,江锦秀,张靖鹏,游伟,胡奇林. 2019

[11]绵羊肺炎支原体SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立. 林裕胜,江锦秀,张靖鹏,游伟,胡奇林. 2018

[12]多花水仙WRKY转录因子的克隆与序列分析. 李欢,何炎森,李科,申艳红,吴用,陈晓静. 2014

[13]三株鸭源H9N2亚型禽流感病毒福建株全基因的测序及遗传进化分析. 万春和,傅光华,施少华,程龙飞,陈红梅,黄瑜. 2012

[14]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[15]伪狂犬病毒Fa株gB、gC、gD基因的克隆与序列分析. 陈振海,林天龙,陈少莺,宋铁英. 2007

[16]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[17]多花水仙HDS基因cDNA全长克隆与序列分析. 吴用,何炎森,李科,申艳红,李欢,陈晓静. 2015

[18]琯溪蜜柚黄龙病病原的克隆及序列分析. 田亚南,柯穗,李韬,柯冲. 2002

[19]番鸭呼肠孤病毒σB和σNS基因克隆及序列分析. 林锋强,胡奇林,欧阳岁东,陈仕龙,程晓霞,王劭,朱小丽. 2006

[20]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

作者其他论文 更多>>