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甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 苏在兴 1 ; 李强 2 ; 唐维 3 ; 刘亚菊 4 ; 后猛 3 ;

作者机构： 1.中国农业科学院

2.云南农业大学植物保护学院

3.中国农业科学院甘薯研究所江苏徐州甘薯研究中心

4.江苏徐州甘薯研究中心

关键词： 甘薯;果糖-1;6-二磷酸醛缩酶;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 11 期

页码： 2469-2476

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用甘薯徐薯18和徐781转录组测序结果,筛选到一条与淀粉合成相关的差异表达Unigene,编号为T1-30656。以徐781为材料,克隆该片段,并对其进行重测序和生物信息学分析。结果表明,该片段为果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的c DNA序列,该基因包含3个外显子和2个内含子,亚细胞定位在细胞质当中,将其命名为Ib FBA5。该c DNA长为1 341 bp,含1 074 bp的开放阅读框,编码357个氨基酸。其序列与番茄、油菜、粳稻和拟南芥等相似性在77%~79%之间。

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