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两种养殖模式下黑鲷肠道及养殖水体菌群结构特征的研究

文献类型: 中文期刊

作者: 聂志娟 1 ; 邵乃磷 1 ; 张志伟 2 ; 胡佳雯 3 ; 徐跑 1 ; 徐钢春 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

2.江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室

3.南京农业大学无锡渔业学院

关键词: 池塘流水槽循环水养殖;黑鲷;菌群结构;高通量测序;肠道

期刊名称: 中国农学通报

ISSN:

年卷期: 2021 年 027 期

页码: 155-164

收录情况: CSCD

摘要: 为了研究池塘流水槽循环水黑鲷养殖模式(IP)和传统池塘黑鲷养殖模式(EP)菌群结构特征,运用高通量测序技术,比较分析2种养殖模式黑鲷肠道和养殖水体中菌群组成结构与功能。结果显示:黑鲷肠道和养殖水体中主要由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻细菌(Cyanobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和绿弯菌门(Chloroflexi)组成,其丰度之和为98.32%~99.22%;在属水平上,菌属差异明显,IP模式下黑鲷肠道显著增加的菌属包括鲁杰氏菌属Ruegeria(14.84%)、聚球藻属Synechococcus(14.24%)、Marivita(3.58%)、noranko<sub>PeM15(2.97%)、norankC<sub>KD4-96(2.56%)(P<0.05)(IP>EP);而EP模式下,黑鲷肠道中肠杆菌属Enterobacter(10.31%)、分支杆菌属Mycobacterium(10.30%)、Romboutsia(7.37%)、肠球菌属Enterococcus(6.29%)、乳球菌属Lactococcus(5.38%)显著增加(P<0.05)(IP0.05)。2种养殖模式条件下菌群结构存在差异,且存在较多丰度差异显著的菌属。IP模式下黑鲷肠道中具有差异显著的优势菌属大多为有益菌,而EP模式黑鲷肠道多为慢性致病菌或条件致病菌属。

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