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甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 昝领兄 1 ; 李开祥 1 ; 贾永鹏 1 ; 杜德志 1 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院青海省春油菜遗传改良重点实验室国家油菜改良中心青海分中心农业农村部春油菜科学观测实验站青海省春油菜工程技术研究中心

关键词: 甘蓝型油菜;HD-ZIP蛋白基因家族;差异表达

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2020 年 29 卷 009 期

页码: 1351-1363

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加.初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据.

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