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柑橘黄龙病菌核糖体蛋白基因的多态性及系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 鹿连明 1 ; 范国成 2 ; 姚锦爱 2 ; 胡秀荣 1 ; 陈国庆 1 ;

作者机构： 1.浙江省柑橘研究所

2.福建省农业科学院

关键词： 亚洲种黄龙病菌;核糖体蛋白基因;多态性;系统发育分析

期刊名称： 浙江大学学报(农业与生命科学版)

ISSN： 1008-9209

年卷期： 2011 年 37 卷 02 期

页码： 125-132

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过PCR扩增6个不同地区柑橘黄龙病(citrus huanglongbing,HLB)病原菌的核糖体蛋白基因,采用4种不同的限制性内切酶对PCR产物进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析;并对核糖体蛋白基因克隆和测序后,使用DNAman和NCBI Blast等软件对基因序列进行比对分析,并通过软件Mega4.1构建其系统发育树.结果表明:6个分离物核糖体蛋白基因的RFLP指纹图谱有所差异,表现出一定的多态性;不同分离物核糖体蛋白基因的核酸序列和氨基酸序列均存在差异,但相互之间同源性很高,其中核酸序列与数据库中亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus)的同源性高达99%~100%,与非洲种(Ca.L.africanus)的同源性为85%,与美洲种(Ca.L.americanus)的同源性为77%~80%;系统发育分析显示所有的Ca.L.asiaticus亲缘关系极近,归为一个类群,而后与Ca.L.africanus和Ca.L.americanus组成韧皮部杆菌属(Candidatus Liberibacter)一个大的类群.

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