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西瓜核心种质遗传多样性分析及指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 徐彦刚 1 ; 姚协丰 1 ; 李良俊 2 ; 徐锦华 1 ; 任润生 1 ; 张曼 1 ; 刘广 1 ; 娄丽娜 1 ; 朱凌丽 1 ; 侯茜 1 ; 徐建 1 ; 羊杏平 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院蔬菜研究所

2.扬州大学园艺与植物保护学院

关键词: 西瓜;SSR多态性标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 305-317

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 深入了解西瓜核心种质资源的群体结构及遗传多样性,可以准确指导亲本间杂交组合的有效配置,避免具有相似遗传背景材料的组合,以便提高育种效率。据此,本研究通过采用45对具有多态性的SSR标记对不同来源的78份西瓜核心种质进行了多元统计分析。结果表明,45个SSR标记共检测出175个位点,其中具有多态性位点数为165个,多态性比率达95.41%,且每对引物平均检测到等位基因位点3.67个,PIC大小范围在0.049~0.781之间,平均值为0.415,其有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)、多样性指数(I)及Nei’s基因多样性指数(H)在该群体水平上分别为2.258、0.479、0.521、0.850和0.476,同时筛选出了28对多态性高、带型稳定、易于统计的核心引物,构建了78份西瓜核心种质的SSR指纹图谱。群体结构分析表明,78份西瓜核心种质资源划分为2大类群和4个亚群,其中来自不同地域的美国材料和日本材料分别独立趋于2大类群中,而中国种质材料普遍交叉分布于2大类群中,且各亚群之间存在着明显的基因交流,分子方差分析表明种质间遗传多样性主要存在于品种间和居群间。

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