文献类型： 中文期刊

作者： 段龙飞 ¹ ; 李文燕 ² ; 慕小倩 ³ ; 张园园 ¹ ; 郭邦利 ¹ ; 陈国爱 ¹ ;

作者机构： 1.安康市农业科学研究所

2.广东省农业科学院农业生物基因研究中心

3.西北农林科技大学生命科学学院

关键词： 茉莉酸信号;COI蛋白家族;系统发育;扩增与进化;基因表达

期刊名称： 生物信息学

ISSN： 1672-5565

年卷期： 2016 年 14 卷 03 期

页码： 146-155

摘要： 茉莉酸(Jasmonic acid,JA)存在于所有高等植物中,是植物对病原微生物和虫害防御反应的关键激素。在茉莉酸信号转导中,COI1(COR-insensitive 1)作为茉莉酸信号受体蛋白在其中发挥关键作用。本研究采用生物信息学方法,从藻类、苔藓类、蕨类、裸子及单、双子叶植物多谱系对COI蛋白家族进行比较基因组学研究,并取得以下结果:(1)同源基因鉴定结果发现,在所选的7种陆生植物中一共鉴定了55个COIs同源基因,然而,在低等的水生植物包括绿藻类(Chlorophytes)、红藻类(Rhodophytes)、硅藻类(Bacillariophytes)、灰胞藻类(Glaucophytes)及褐藻类(Phaeophytes)等基因组中均未发现其同源基因;(2)系统进化树分析表明,植物COI蛋白家族可以分为4个保守的亚家族,且在陆生植物扩增的同时可能已发生功能分化;(3)基因结构分析显示,植物COI家族基因结构表现多样性,主要体现在内含子的数目和长度上;(4)基因表达数据提示,COI基因家族成员参与植物生长发育的多个时期,且在不同组织器官以及不同的胁迫应答反应中发挥不同的作用。以上结果将为植物COI基因家族的深入研究提供参考。