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绣球WRKY基因家族全基因组鉴定及其响应叶斑病的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘欣童 1 ; 陈慧杰 2 ; 陈双双 2 ; 冯景 2 ; 齐香玉 2 ; 周惠民 2 ; 金玉妍 2 ; 孙明 2 ; 邓衍明 2 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院休闲农业研究所

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关键词: 绣球;WRKY基因家族;转录因子;叶斑病;多主棒孢菌

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2025 年 40 卷 001 期

页码: 93-103

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解析绣球WRKY转录因子家族的成员特征及其在绣球叶斑病应答中的作用,利用生物信息学方法,对绣球无尽夏基因组中的WRKY家族成员进行全基因组鉴定,并系统分析了蛋白质理化特征、基因结构、系统进化、共线性和家族成员在多主棒孢菌侵染下的表达模式。结果表明:绣球全基因组中共鉴定到84个非冗余的HmWRKY成员,均属于亲水性蛋白,在绣球18条染色体上呈现不均匀分布,编码氨基酸112~1 046个;所有成员可分为3个亚组,即GroupⅠ~GroupⅢ,均含有WRKYGQK和C2H2组成的DNA结合域;HmWRKY成员的序列长度变化较大,从512 bp到40 338 bp,并且检测到8个存在共线性的基因对,Ka/Ks的比值均小于1,说明HmWRKY家族在进化中趋于纯化选择;同时,18个HmWRKY成员在绣球叶斑病菌侵染后表现出显著差异表达的特性,其中9个上调表达、9个下调表达。以上结果表明,HmWRKY基因在绣球响应叶斑病中可能具有重要作用。

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