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绵羊PDK4基因序列克隆、分析及亚细胞定位

文献类型: 中文期刊

作者: 曹阳 1 ; 方文文 1 ; 刘宇 1 ; 刘昕昕 1 ; 肖成 1 ; 李欣 1 ; 于长辉 2 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)畜牧兽医研究所

2.吉林省乾羊农牧业有限公司

关键词: PDK4;绵羊;选择性多聚腺苷酸化;亚细胞定位

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 60 卷 011 期

页码: 359-363

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了明确丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因的结构,利用c DNA末端快速扩增技术(RACE),以绵羊脂肪组织总RNA为模板扩增得到绵羊PDK4基因全部序列,使用生物信息学软件对扩增得到的序列进行分析,并预测其蛋白结构,通过免疫荧光染色观察PDK4亚细胞定位,RT-PCR检测其在绵羊各组织中的表达。结果表明:绵羊PDK4基因序列共存在6个转录本,其中最长转录本长度为4 018 bp,5'UTR为289 bp,开放阅读框长为1 224 bp,3'UTR存在选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation,APA)现象,有6条不同长度的3'UTR,分别为120、512、672、1 418、2 245、2 505 bp,其中编码区共编码407个氨基酸,理论分子质量为46.21 ku,等电位点为6.90,为亲水性蛋白,无信号肽,不属于分泌蛋白,与其他物种PDK4进行同源性比对,发现其与牛和山羊的同源性最高;预测其亚细胞定位于线粒体、细胞质和核,通过免疫荧光染色将PDK4与线粒体和细胞核共定位,结果发现其在线粒体表达中较多,少量存在与细胞核中;检测PDK4基因在40日龄羔羊各组织中表达水平,其在肌肉组织中表达最高,在肺中表达最低。本研究通过对绵羊PDK4全序列克隆、蛋白结构分析以及亚细胞定位,为绵羊PDK4的后续研究提供了有效信息和理论依据。

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