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健康犊牛直肠细菌的多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 许强 1 ; 马勋 1 ; 康立超 2 ; 薄新文 2 ; 王新华 2 ;

作者机构： 1.石河子大学动物科技学院

2.新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室

关键词： 犊牛直肠;多样性;限制性片段长度多态性(RFLP);16S rRNA序列

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2012 年 49 卷 01 期

页码： 127-132

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究分析健康犊牛直肠细菌的多样性。【方法】通过建立直肠菌群16S rRNA基因克隆文库,分别用限制性内切酶Msp I和Hha I对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,通过测定16S rRNA基因序列,绘制进化树,确定健康犊牛直肠菌群的组成。【结果】克隆阳性率达96.45%(488/506),Msp I得到64种分类操作单元(OTU,Operational Taxonomic Unit),Hha I得到45种OTU,综合获得143种OTU。测序比对表明健康犊牛直肠优势菌群分属梭菌属(13%)、双歧杆菌属(8%)、拟杆菌属(3%)、真杆菌属(3%)、乳杆菌属(2%)、普氏菌属(2%)、埃希菌属(4%)、巨型球菌属(5%)和不可培养菌(8%)。【结论】健康犊牛直肠菌群复杂多样,且多为专性厌氧菌,以梭菌属、双歧杆菌属和巨型球菌属为主要类群。此外,巨型球菌属在1～2周龄犊牛直肠中具有独特性。

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