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利用SNP分子标记分析化橘红种质资源

文献类型： 中文期刊

作者： 赵俊生 1 ; 杨晓燕 2 ; 曾祥有 3 ; 钟声 3 ; 方静 2 ;

作者机构： 1.华南农业大学园艺学院

2.珠海市果树科学技术推广站

3.广东省茂名市水果科学研究所

关键词： 化州橘红;单核苷酸多态性;高分辨率熔解曲线;聚类分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 05 期

页码： 1203-1211

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型。结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.363 1,多样性信息含量(PIC)平均值为0.266 3;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具。另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的"正毛"、"密叶正毛"、"副毛"、"光青"、"假西洋"、"黄龙"6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象。本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔。

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