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利用SNP分子标记分析化橘红种质资源

文献类型: 会议论文

第一作者: 赵俊生

作者: 赵俊生 1 ; 杨晓燕 2 ; 曾样有 3 ; 钟声 4 ;

作者机构: 1.农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室,广东省农业科学院果树研究所,广州,510640

2.茂名市水果科学研究所,茂名,525000

3.华南农业大学园艺学院,广州,510640

4.茂名市农作物技术推广站,茂名,525000

关键词: 化州橘红;单核苷酸多态性;高分辨率熔解曲线;聚类分析

会议名称: 广东省园艺学会第十一届会员大会暨广东园艺产业创新与发展学术研讨会

主办单位: 广东省园艺学会

页码: 00000072-00000080

摘要: 本研究利用高分辨率熔解曲线(High resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型.结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.3631,多样性信息含量(PIC)平均值为0.2663;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具.另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的"正毛"、"密叶正毛"、"副毛"、"光青"、"假西洋"、"黄龙"6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象.本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔.

分类号: S666.2:S603

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