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美国红枫叶片转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭聪 1 ; 王莹 1 ; 谈峰 1 ; 陈燕 1 ; 李玉娟 1 ;

作者机构： 1.江苏沿江地区农业科学研究所

关键词： 美国红枫;转录组;叶色变化;差异表达基因

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2020 年 03 期

页码： 441-454

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 美国红枫(Acer rubrum)叶色鲜红美丽,在园林植物中被广泛的应用,同时也常用作防护林树种和风景林树种。为了了解美国红枫转色期叶片中差异表达基因及分子调控途径,本研究对美国红枫转色期叶片进行RNA-Seq测序和分析,共获得unigenes 78 571条,总长度为71 788 869 bp,平均长度913.68 bp。通过与蛋白数据库的比对,48 387条unigenes可获得注释信息。基因本体(Gene Ontology, GO)分析发现注释到的基因涉及53个功能组,其中代谢过程(生物学过程)、细胞(细胞组分)以及催化活性(分子功能)的富集程度较高。KEGG分析发现差异表达基因主要对核糖体代谢等生物学过程进行调节。在叶片转色期间,共筛选出7个与花青素相关的转录因子,主要经丙烷类生物合成、花青素生物合成、类黄酮生物合成等机制介导美国红枫叶色调控。同时发现这7个转录因子在红叶或者花叶中表达量较高,进一步提示其在美国红枫叶片转色期可能发挥重要的作用。本研究结果为探究美国红枫叶色变化的分子机制研究提供了参考。

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