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4株H3N2亚型猪源流感病毒HA基因的序列测定与特性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李敏 1 ; 向华 2 ; 宣华 1 ;

作者机构： 1.吉林大学

2.广东省农业科学院

关键词： 猪流感;H3N2亚型;HA基因;序列测定与分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2009 年 29 卷 11 期

页码： 1424-1428

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从广东省不同猪场分离到4株H3N2亚型猪源流感病毒A/Swine/Guangdong/01/2004、A/Swine/Guang-dong/02/2004、A/Swine/Guangdong/03/2004、A/Swine/Guangdong/04/2004。根据GenBank公布的H3N2亚型猪源流感病毒的HA基因序列,设计1对引物,运用RT-PCR方法扩增四株病毒的HA基因,并进行测序和分析。同源性分析和遗传进化分析表明本实验的4株H3N2亚型SIV HA基因核苷酸序列同源性为99.8%~99.9%,在遗传进化树中均位于同一分支上。与参考毒株的比较分析表明,4个毒株与WHO推荐的2001—2004年北半球H3N2亚型流感疫苗株A/Moscow/10/99 HA基因的核苷酸序列同源性最高为99.4%~99.5%,4个毒株与A/Moscow/10/99 HA基因在遗传进化树中位于同一个小分支上。氨基酸序列比较发现,4个毒株HA基因裂解位点处的氨基酸序列均为PEKQTR↓G,4个毒株推导的氨基酸序列中均有11个糖基化位点,4个毒株HA蛋白226位受体结合位点(RBS)处氨基酸均为异亮氨酸(Ⅰ)。4个毒株HA基因的氨基酸序列、受体结合位点以及糖基化位点均与A/Moscow/10/99相应的氨基酸序列一致。本试验的4株H3N2亚型猪源流感病毒的HA基因属于以A/Moscow/10/99为代表的近代类人H3N2亚型流感病毒,在一定程度上揭示了广东省H3N2亚型猪流感病毒HA基因进化与流行情况。

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[1]H1N1亚型猪流感诊断方法的研究新进展. 蔡春梅,翟少伦,温肖会,林美玲,严颖,周秀蓉,袁洁. 2015

[2]广东省H1和H3亚型猪流感病毒抗体血清学调查. 徐敏,贾春玲,杨德胜,魏文康,朱燕秋,黄元,陈晶,张健騑,宣华,向华. 2010

[3]广东地区H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因生物学特征分析. 曾庆航,刘杨,孙敏华,胡鑫宇,谢梓民,张敏霞,袁朝霞,廖明. 2023

[4]表达猪源流感病毒HA基因重组伪狂犬病毒的构建. 李敏,向华,张丽,黄元,王贵平,宣华. 2009

[5]H1N1亚型猪流感病毒HA和NA基因双重RT-PCR定型检测方法的建立与应用. 温肖会,蔡春梅,魏文康,翟少伦,吕殿红,贾春玲,袁洁,黄忠,周秀蓉. 2014

[6]猪流感的流行及其公共卫生学意义. 李敏,广东省农科院兽医研究所,向华,严悌昆,广东省农科院兽医研究所. 2006

[7]猪流感在人际间的传播. 禹思宇,向华,张健(馬非). 2010

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