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桃NAC基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张春华 1 ; 上官凌飞 2 ; 俞明亮 1 ; 张彦苹 2 ; 马瑞娟 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院园艺研究所

2.南京农业大学园艺学院

关键词： 桃;NAC基因家族;生物信息学

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2012 年 28 卷 02 期

页码： 406-414

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注。为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组骨架上分布、表达模式、假定蛋白质结构和亚族分类。预测结果显示桃NAC基因家族包含115个假定NAC蛋白质,被分为17个亚族,且与拟南芥中NAC家族基因具有一定的相似性;1个NAC基因分布在11号骨架上,其余分布在1～8号基因组骨架上;对一级结构的分析结果显示桃NAC家族蛋白质分子量和氨基酸数目成正相关,绝大多数是亲水氨基酸,各亚族间等电点没有规律;115个蛋白质的二级结构全部以无规则卷曲为主要构成元件,且它们的三级结构大部分相似。在果皮中表达的NAC家族基因数最多,达到75%;在花芽中表达的NAC家族基因数较少,为1%。

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