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水体中盐单胞菌属(Halomonas)细菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 张艳 1 ; 李秋芬 1 ; 成钰 1 ; 费聿涛 1 ; 姜娓娓 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 异养硝化-好氧反硝化细菌;Halomonas sp.;实时荧光定量PCR;人工鱼礁

期刊名称： 应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2016 年 22 卷 01 期

页码： 140-145

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过制备标准曲线模板,针对一株盐单胞属细菌X3(经鉴定为Halomonas alkaliphila)的16S r DNA序列设计和筛选特异性引物,建立水体中盐单胞菌属细菌的实时荧光定量PCR检测方法,并将该法用于检测莱州人工鱼礁海域Halomonas属细菌数量.结果表明,引物X3-3F和X3-3R能够对Halomonas属的细菌进行特异性检测,对细菌浓度为6.75×10~1-6.75×10~7 CFU/m L检测重复性和稳定性较好,最低检出浓度为67.5 CFU/m L.运用建立的方法对莱州人工鱼礁海域水体样品的检测结果表明,在未投礁海域2011年5月和7月水体样品中Halomonas细菌数量分别为8.71×10~3 CFU/m L和2.37×10~3 CFU/m L,而投礁区5月份水样也检出了该属细菌,但荧光信号较弱,7月份水样未检出该属细菌.本研究可为Halomonas属细菌的快速检测及其在海水养殖水质净化方面的推广应用提供有力的技术支撑.

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