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辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的建立及优化

文献类型： 中文期刊

作者： 陶丽婷 1 ; 杨世鹏 2 ; 王丽慧 2 ; 李屹 2 ; 李莉 3 ;

作者机构： 1.青海大学农林科学院/青海省蔬菜遗传与生理重点实验室

2.;青海大学农林科学院/青海省蔬菜遗传与生理重点实验室

3.;青海大学农林科学院/青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;

关键词： 辣椒疫霉菌;SSR-PCR;正交设计;体系优化

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 80-83

收录情况： 北大核心

摘要： 为快速有效地确定辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系,采用正交优化设计方法,对影响辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的4个主要因素(模板DNA、引物、d NTPs、Taq酶)在4个水平上进行优化。结果表明,不同因素下各水平浓度对SSR-PCR的反应结果均有显著性影响,最佳反应体系(20μL)为:1.0 ng模板DNA,0.8μmol/L引物,0.5μmol/L d NTPs,1.0 U Taq酶。PCR扩增程序为:94℃预变性2 min;94℃变性15 s,58.4℃退火30 s,36个循环,72℃延伸2 min,最佳循环数为36。利用该体系对12份辣椒疫霉菌进行验证,证明该体系稳定可靠,本试验为辣椒疫霉菌遗传多样性分析研究及分子育种奠定了理论基础。

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[2]黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选. 李颖,谢占玲,田飞,贾贤卿,方慧,夏明哲. 2013

[3]蚕豆SSR-PCR体系建立及优化. 沙伟超,侯万伟,刘玉皎,田莹莹,武学霞. 2017

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[7]1株中度嗜盐菌提取物对辣椒疫霉菌的抑制活性. 沈硕. 2015

[8]纳米氧化亚铜对辣椒疫霉菌和根腐病菌的抑制作用. 杨君丽,董汇泽,李屹,田晓丽,侯全刚. 2012

[9]青海省辣椒疫霉菌生理小种鉴定. 王丽慧,陶丽婷,谭龙,李屹. 2017

[10]线辣椒SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选. 李全辉,李江,邵登魁,王亚艺,侯全刚,钟启文. 2017

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