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黄喉拟水龟巨噬细胞炎症蛋白-3α基因的序列特征与组织表达

文献类型: 中文期刊

作者: 龙建杰 1 ; 朱新平 1 ; 史燕 1 ; 赵密 2 ; 刘阳 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室

2.上海海洋大学水产与生命学院

关键词: 黄喉拟水龟;巨噬细胞炎症蛋白-3α;cDNA文库;序列分析;组织表达

期刊名称: 华中农业大学学报

ISSN: 1000-2421

年卷期: 2013 年 32 卷 05 期

页码: 112-118

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用已构建的黄喉拟水龟(Ma)SMART全长cDNA文库,筛选得到巨噬细胞炎症蛋白-3α(MIP-3α)全长cDNA序列,通过设计引物、克隆测序验证,采用相关软件对基因的结构与功能进行预测,并利用实时荧光定量PCR对MaCCL20组织表达特征进行分析。序列结构分析结果表明,MaCCL20 cDNA全长2 318 bp,开放阅读框为261 bp,共编码86个氨基酸,其蛋白为疏水性,不存在跨膜结构。同源性分析表明,黄喉拟水龟CCL20与变色蜥(Anolis carolinensis)亲缘关系最近,与原鸡(Gallus gallus)其次,与哺乳动物的同源性很低;荧光定量PCR结果表明,MaCCL20在肝脏、肾脏、心脏、脾脏中均有表达,其中脾脏中表达量最高。

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