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玉米苗期根部比较转录组分析揭示耐盐性差异机制

文献类型: 中文期刊

作者: 董菁 1 ; 张春宵 2 ; 刘学岩 2 ; 金峰学 2 ; 刘文平 2 ; 吴委林 1 ; 李晓辉 2 ;

作者机构: 1.延边大学农学院

2.吉林省农业科学院玉米研究所

关键词: 玉米;苗期;耐盐;转录组;基因挖掘

期刊名称: 玉米科学

ISSN: 1005-0906

年卷期: 2023 年 006 期

页码: 30-40

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以耐盐自交系郑58和盐敏感自交系昌7-2为材料,分析供试材料在无胁迫(CK)和200 mmol/L NaCl溶液胁迫下5 h的转录组数据。与无胁迫(CK)相比较,在郑58和昌7-2分别鉴定出390和421个上调、390和421个下调差异基因。对耐感材料间共同上调和郑58特有上调DEGs进行GO富集、REVIGO分析和KEGG富集分析以及重点通路分析结果表明:郑58和昌7-2间共同上调DEGs显著富集的条目包括对活性氧代谢过程的调节、内质网应激反应等GO条目;郑58特有上调显著富集含氧化合物的反应、对化学物质的反应等GO条目。共同上调DEGs仅在共单萜生物合成的代谢通路上显著富集;郑58特有上调DEGs在植物激素信号转导、苯丙烷生物合成等6个通路上显著富集。在植物激素信号转导、苯丙烷生物合成两个通路上分别有9和7个相关基因,耐盐自交系郑58上调的转录因子在MYB和NAC家族分布数量较多。植物激素信号转导、苯丙烷生物合成通路相关的基因以及MYB和NAC家族基因可能与玉米耐盐性密切相关。

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