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白羊草BiCDPK基因保守区的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王运琦 1 ; 方志红 1 ; 任彬琳 1 ; 李莲芬 1 ; 董宽虎 2 ;

作者机构： 1.山西省农业科学院畜牧兽医研究所

2.山西农业大学动物科技学院

关键词： 白羊草;BiCDPK;基因克隆

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2016 年 32 卷 24 期

页码： 130-135

收录情况： CSCD

摘要： 为了研究CDPK基因的结构和功能,利用RT-PCR方法从白羊草中克隆得到Bi CDPK基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明:该Bi CDPK基因c DNA长1048 bp,包含387 bp的开放阅读框,编码128个氨基酸。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主。亚细胞定位于细胞质中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在1个丝氨酸磷酸化位点和3个苏氨酸磷酸化位点。进化分析结果表明,克隆的Bi CDPK基因与玉米、小麦和水稻具有较高同源性,相似度分别是97%、86%、86%。为进一步研究Bi CDPK基因的功能奠定了基础。

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