文献类型： 中文期刊
作者： 杨海乐 1 ; 许兰馨 1 ; 吴金明 1 ; 杜浩 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所
关键词： eDNA监测;小尺度时空差异;重复采样;16S rRNA基因;COI基因;长江
期刊名称： 湖泊科学
ISSN： 1003-5427
年卷期： 2025 年 37 卷 004 期
页码： 1175-1188
收录情况： EI ; 北大核心 ; CSCD
摘要： 样品重复数设计是环境DNA(eDNA)监测技术标准化中最靠前的一个关键环节,对特定站位或断面进行eDNA监测,采样中应该设置多少个样品重复先前已有研究探讨,而这种小时空尺度的样品重复应该是在空间上设置系列样点,还是在时间上设置连续采样尚未有研究仔细探讨,但这对于eDNA监测实践十分重要。为解决大型河流eDNA监测中重复采样策略的优化问题,本研究在长江武汉段设计了以样品重复方式为单一变量的对照实验,通过比较不同重复方案下eDNA监测检出的物种组成差异,提出适用于小时空尺度eDNA监测的采样建议。结果显示,细菌和后生动物的eDNA监测空间序列样品比时间序列样品所检出的累计物种数多,所检出物种组成的空间异质性比时间异质性大,而真菌、真核藻类、原生动物3个细分类群相反。因此,建议在大型河流小时空尺度的eDNA监测中,监测细菌和后生动物时,样品重复的设计优先关注空间重复采样;监测真菌、真核藻类、原生动物时,样品重复的设计优先关注时间重复采样,考虑到可能存在的河流特异性、断面特异性、时间特异性,本结论可能需要进行异时异地验证。特别强调,采取空间重复采样应注意采样时间的选择,采取时间重复采样应注意采样点位的选择,针对细分类群的监测采样应注意保证样品重复数量。
- 相关文献
[1]大型河流中鱼类组成的eDNA监测效率:以长江武汉江段为例. 杨海乐,吴金明,张辉,杜浩,李君轶,王成友,沈丽,刘志刚,危起伟. 2021
[2]仿刺参(Apostichopus japonicus)mtDNA三个基因片段的序列分析. 李颖,刘萍,孙慧玲,马甡,高天翔,王清印. 2006
[3]利用16S rRNA和COI基因序列对三疣梭子蟹不同群体遗传特征的比较分析. 高俊娜,刘萍,李健,潘鲁青,高保全,陈萍. 2010
[4]4种鳕鱼线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段序列的比较研究. 毕潇潇,高天翔,肖永双,李永振. 2009
[5]长江安徽段渔业生态环境的评价. 胡庚东,陈家长,吴伟,瞿建宏,李话. 1999
[6]拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选. 马群群,马洪雨,马凌波,马春艳,崔海玉. 2010
[7]基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究. 单云晶,鲁翠云,李超,张明昭,顾颖,孙效文. 2013
[8]中国绥芬河三块鱼不同群体的种属划分及起源. 常玉梅,程磊,孙博,苏宝锋,梁利群,王维坤. 2018
[9]基于线粒体COI基因的南海浮游介形类斜突浮萤(Proceroecia procera)单倍型与种群遗传结构研究. 徐磊,季莹莹,黎红,杜飞雁. 2019
[10]基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性. 田吉腾,侯丫,刘志鸿,杨爱国,吴彪,周丽青,董春光. 2016
[11]中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化. 王鹤,林琳,柳淑芳,姜志强,庄志猛. 2011
[12]基于DNA条形码研究中国枪乌贼和鸢乌贼的食物种类组成. 刘梦娜,徐磊,王雪辉,刘玉,王淼娣,邱永松,朱江峰,何映霖,贝伟烈,杜飞雁. 2020
[13]Real-time PCR法检测水产品中异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭源性成分. 信红梅,姚琳,陆键萍,曲梦,江艳华,李风铃,郭莹莹,王联珠. 2020
[14]中国东南沿海弹涂鱼科常见鱼类的遗传多样性和DNA条形码. 杨帆,何利军,雷光春,张爱兵. 2012
[15]鲫属鱼类DNA条码及种与亚种划分. 程磊,常玉梅,鲁翠云,曹顶臣,孙效文. 2012
[16]七鳃鳗属3种类的亲缘关系分析. 常玉梅,黄晶,孙博,苏宝锋,梁利群. 2018
[17]基于线粒体COI基因序列的金乌贼群体遗传学研究. 单斌斌,宋娜,刘淑德,涂忠,王晓梅,高天翔,韩志强,张秀梅. 2017
[18]南极鱼亚目鱼类DNA条形码及分子系统学. 姜郦轩,张吉昌,樊钢洲,李昂,柳淑芳,庄志猛. 2021
[19]基于线粒体COI基因的6个黄鳝群体遗传多样性. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟. 2018
[20]三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨(英文). 张凊漪,程起群,管卫兵. 2009
作者其他论文 更多>>
-
天然水域产卵生境营造下长江鲟自然繁殖行为特征及效果
作者：李鹏程;吴金明;李君轶;仲嘉;刁亚芹;周波;周亮;禄盛超;王煜琦;杜浩
关键词：长江鲟;生境营造;产卵场;繁殖行为
-
天然水域人工模拟产卵环境诱导长江鲟自然繁殖后代的亲权分析
作者：程佩琳;刘青娟;李鹏程;吴金明;李君轶;冷小茜;吴金平;仲嘉;俞丹;刘焕章;杜浩
关键词：长江鲟;亲子鉴定;遗传多样性;交配模式;种群恢复
-
淡水养殖中华鲟与长江鲟幼鱼海水渗透调节能力比较
作者：王谱渊;冷小茜;任飞翔;仲嘉;程佩琳;张立宁;乔新美;杜浩
关键词：中华鲟;长江鲟;淡水养殖;渗透调节
-
不同饵料对长江鲟亚成体生长、激素合成及健康状况的影响
作者：王煜琦;符鹏;吴金平;张闯;沈丽;冷小茜;李罗新;刘志刚;罗江;杜浩
关键词：长江鲟;亚成体;配合饲料;冰鲜鱼;蚯蚓干;生长性能;激素合成;健康状况
-
长江流域外来鱼类现状与生态风险评估
作者：万朝阳;方康;董芳;张蓥钰;吴金明;牟希东;张辉
关键词：外来鱼类;风险评估;外来水生生物风险筛选工具(AS–ISK);长江流域
-
禁捕初期长江上游长江鲟增殖放流效果
作者：刘文成;李君轶;吴金明;叶海明;李鹏程;沈丽;杜浩
关键词：长江上游;禁捕初期;增殖放流;体长–体重;长江鲟
-
eDNA监测空间分辨率量化方法研究-以长江中游干流平水期为案例
作者：杨海乐;许兰馨;周琼;刘志刚;吴金明
关键词：环境DNA监测;空间分辨率;可信度与覆盖度;流域生物信息流;流域生态学
